Okrem vnútorných auditov, ktoré sú zaradené v ročnom pláne, môže útvar vnútorného auditu v odôvodnených prípadoch, najmä pri podozrení na výskyt nepredvídaných rizík, na základe rozhodnutia štatutárneho orgánu alebo s jeho súhlasom, vykonať vnútorný audit, ktorý nebol uvedený v ročnom pláne. V prípade, že nastane situácia podľa predchádzajúcej vety, nevyžaduje sa vykonanie zmeny ročného plánu; informácie o vnútornom audite, ktorý bol vykonaný nad rámec ročného plánu, oznámi útvar vnútorného auditu ministerstvu financií prostredníctvom ročnej správy o vykonaných vnútorných auditoch. V prípade potreby zmeny alebo doplnenia (napr. pri zmene počtu zamestnancov útvaru, pri prehodnotení priorít) schváleného strednodobého plánu alebo ročného plánu a na základe aktuálneho prehodnotenia rizík, sa vypracuje dodatok k strednodobému plánu a/alebo ročnému plánu. V predmetnom dodatku sa náležite odôvodnia jednotlivé zmeny alebo doplnenia. Dodatok k plánom vnútorného auditu schvaľuje štatutárny orgán podľa § 17 ods. 4 zákona č. 357/2015 Z. z. a každá zmena v plánoch vnútorného auditu sa podľa § 18 ods. 1 písm. a) zákona č. 357/2015 Z. z. zasiela ministerstvu financií a Najvyššiemu kontrolnému úradu SR do desiatich pracovných dní odo dňa jej schválenia.