Zákon č. 357/2015 Z. z. v § 28 exaktne ustanovuje, v ktorých prípadoch je oprávnený na uloženie pokuty SKŠR, ktorý vykonal vnútorný audit (ods. 1 až 4 a 7). Zároveň je v § 28 ods. 13 zákona č. 357/2015 Z. z. uvedené, že na konanie o uloženie pokuty podľa odsekov 1 až 6 sa vzťahuje Správny poriadok. Zákon č. 357/2015 Z. z. však bližšie neustanovuje organizačnú a funkčnú príslušnosť pre správny orgán, t. j. kto v rámci SKŠR má plniť úlohu prvostupňového orgánu a kto úlohu druhostupňového orgánu.
Ustanovenie ohľadne pôsobnosti v správnom konaní obsahuje Správny poriadok v § 1 ods. 2, podľa ktorého správnym orgánom je štátny orgán, orgán územnej samosprávy, orgán záujmovej samosprávy, fyzická osoba alebo právnická osoba, ktorej zákon zveril rozhodovanie o právach, právom chránených záujmoch alebo povinnostiach fyzických osôb a právnických osôb v oblasti verejnej správy. Podľa § 6 ods. 2 Správneho poriadku, ak je na konanie vecne príslušný správny orgán, ktorý sa vnútorne člení, orgánom príslušným konať v mene tohto správneho orgánu v prvom stupni je útvar určený zákonom, inak útvar určený štatútom alebo iným predpisom upravujúcim jeho vnútorné pomery. Ak štatút takýto útvar neurčuje, príslušným na konanie je štatutárny orgán správneho orgánu.